Huminstoffer er naturlig forekommende organiske forbindelser som dannes når døde planter og småkryp brytes ned av mikroorganismer i fravær av oksygen. Denne anaerobe nedbrytningsprosessen går svært langsomt, og det kan ta tusenvis av år før dødt plantemateriale er fullstendig omdannet til huminstoffer. Huminstoffer finnes i torv/myr, i brunkull og i slam på bunnen av innsjøer, og de utgjør også en vesentlig del av nedbrytningproduktene i gammel skogsjord, humus.